作為農林廢棄物資源化利用的重要產物，木醋液在美國、日本、韓國等國家的農業生產中得到了很好的應用。在國內，對木醋液的應用研究起步并不晚，但在實際中應用起步較晚。隨著人們對環保與健康的重視，不少科研單位和企業相繼推出了木醋液肥料、農藥和美容保健產品，開始在實際生產和生活中推廣應用，沿海一些發達地區還出現從日、韓進口木醋液微肥用于綠色作物生產的現象。
1、用作植物生長促進劑，直接施于土壤。
在土壤改良上，木醋液和木炭一樣有著極其重要的作用。木醋液中能被作物吸收作為營養補充成分的只有少數，而且具有殺菌、殺蟲作用的物質也只有一小部分。木醋液可以使肥料的吸收性能更好，效果更佳，而且還能減少作物的病蟲害。
在土壤中噴施木醋液不但能促進作物根部的生長，而且還可以改良土壤環境，促進有用微生物的繁殖和促進作物發芽和根系發達，從而促進作物生長，并可防治土傳病害，如對病霉菌、青霉菌、絲核菌、核盤菌、鐮刀菌等多類病原菌均有抑制或殺滅作用，還可防治線蟲等病蟲害，調節土壤PH值，凈化和改良土壤。尤其用于鹽堿地，改良土壤的效果更為明顯。
2、制作木醋液肥噴施于葉面
木醋液可直接作為液肥噴施于植物葉面，起到促進光合作用、加快葉片生長、減緩葉片衰老、防治病蟲害作用。木醋液還可與同倍數量的黑糖酵素混合使用，配成糖木醋液，噴施于作物葉面。木醋液還可與其它材料混合使用，如：果類植物在開花前為抑制徒長促進花芽分化、提高著果率等，可酌量添加磷酸—鈣、磷酸—鉀、硼酸、細胞分裂劑等噴施；幼果期可酌量添加魚精、胺基酸、海藻精、奶粉、綜合微生或微量元素等，可促進果實肥大，但到中期氮質材料應停止使用，而改用磷酸—鈣、磷酸—鉀、乳酸鈣、重磷酸鎂、硫酸錳等以提高糖度，同時降低果實酸度。如有病蟲害可酌量添加海藻精、香茅油、薄荷油、苦楝油、夏油、綜合性有益微生物、蘇力菌等以提高其效果。堿性材料不能與木醋液混合使用。
3、配制活性肥
木醋液、木炭末、木焦油按一定比例配合，也可適量加入其它材料，可制成超級活性肥，具有十大功效：①能提供作物生長過程所需的微量元素；②能促進土壤生物的生態平衡；③能保持肥效；④調節土壤的PH值；⑤保持土壤中的水分；⑥增強土壤的透氣性；⑦使土壤顆?；?；⑧能提高土壤表面的溫度；⑨與農家肥混合使用能提高肥效，防止農家肥對作物的傷害；⑩減輕農作物根腐問題，防治地下病蟲害。
4、作為農藥增效劑
木醋液與農藥混合使用能有效提高農藥的效力。木醋液中許多物質本身具有防治病蟲害作用，其與農藥成份的有機配合、協同作用，可大大提高農藥的效果。另一方面，木醋液能很好地溶解農藥的藥性成份，木醋液中醇類、醛類、酮類等物質分子比水分子小，能很好地滲透到作物的葉、根等組織中去，從而更好地發揮藥效，減少農藥使用量。（注意：木醋液不能與堿性農藥混合使用）
5、用作肥料增效劑
木醋液與肥料混合使用具有提高肥力，延長肥效作用。木醋液具有固定氨中分解出的氮的作用，很好滲透于土壤，防止肥料有效成份揮發。通過促進根系生長，協助氣根固氮，使作物順利吸收土壤中的養分，從而加快作物生長。
6、用作食用菌生長促進劑
木醋液加入食用菌的培養基中，對食用菌的菌絲體、子實體的生長有明顯促進作用。當每公斤培養基中含有0.05—0.25ml木醋液時，對食用菌生長的促進效果最佳。據實驗結果，在培養基中加入0.1—0.6%的木醋液原液，能使實用菌增產21—42%。
7、用作飼料添加劑
木醋液用炭末吸收后添加于飼料中去，可以增加乳酸菌的繁殖，減少內臟特別是腸道內的異常發酵，強化腸胃機能，促進動物的消化吸收，增加家畜的食欲，促進其生長發育，減少肉類飽和脂肪酸含量，增加不飽和脂肪酸含量，改善肉類品質，提高蛋雞產蛋量和蛋的品質，延長保鮮貯存時間。木醋液加入飼料中還可防止飼料霉變，減少動物排泄物的臭味。故木醋液散布于動物糞便，還是很好的除臭劑。木醋液作為飼料添加劑，一般添加量為飼料的0.4%左右。
8、用作水質凈化劑
研究表明，用木醋液處理生活污水，只需100萬分之一的木醋液即可使CODcr（化學需氧量）的去除效果提高10%。因此，用木醋液處理污水可大大節約成本。
